在神医侠侣的故事中，皇上是一个至关重要的角色。然而，在故事的最后，我们并没有看到皇上的确切命运。

在故事的结尾，皇上和他的大臣们一起前往九龙岛，试图寻找长生不老的秘密。然而，在那里，他们遭遇了一系列的挑战和危险。最终，皇上被困在了一个神秘的阵法中，他的命运成为了一个谜。

在这种情况下，我们不能确定皇上是否最终死亡。有些观众认为，皇上应该死亡，因为他的行为导致了许多人的不幸。而其他观众则认为，皇上应该得到救赎，并最终回到他的王座上，因为他也是这个故事中的一个重要人物。

无论皇上的命运如何，我们可以肯定的是，他在整个故事中扮演了一个非常重要的角色。他的决策和行为影响了整个江湖和天下，也塑造了其他角色的命运。最后，无论他是否生还，我们都会记住他在这个故事中的重要性。