芥花籽和菜籽是两种不同的种子，虽然它们都属于十字花科植物，但是它们的形态、特征和用途都有所不同。

首先，芥花籽和菜籽在外观上有明显的区别。芥花籽相对较小，呈椭圆形或卵圆形，表皮呈深褐色或黑色，有明显的凹凸纹路。而菜籽较大，呈圆形或扁圆形，表皮比芥花籽浅色，没有明显的纹路。

其次，芥花籽和菜籽在用途上也有所不同。芥花籽主要用于生产食用油和食品添加剂，例如芥末、调味料等。而菜籽则主要用于生产食用油和饲料，其中菜籽油是中国传统的食用油之一，富含不饱和脂肪酸和维生素E，具有降低胆固醇的作用。

最后，芥花籽和菜籽在种植上也有所不同。芥花籽较为耐寒，适合在春季和秋季种植，而菜籽则适合在春季和夏季种植。此外，芥花籽对土壤要求较高，需要有机质含量高、排水良好的土壤，而菜籽则对土壤要求比较宽松，在耕作上比较容易。

综上所述，芥花籽和菜籽虽然都属于十字花科植物，但在外观、用途和种植上都有所不同。因此，在购买和使用时，需要根据不同的需求进行选择。