不动产证是指国家对于不动产的所有权、使用权、担保权等权利关系所作出的证明文件。一般来说，每一份不动产证都应该只有一个编号，以确保其唯一性和可靠性。然而，在某些情况下，不动产证会出现两个编号的情况，这可能会对不动产的权利关系产生一定的影响。

首先，我们需要了解为什么会出现不动产证有两个编号的情况。一般来说，这种情况可能是因为不动产的权利关系发生了变化，例如房屋的所有权发生了转移、土地使用权发生了变更等。在这种情况下，原有的不动产证可能已经不再适用，需要重新办理新的不动产证。然而，在办理新的不动产证时，有时候会出现原有的不动产证尚未失效的情况，这就会导致新旧两个不动产证都存在，并且都有各自的编号。

那么，这种情况会对不动产的权利关系产生什么影响呢？首先，我们需要明确的是，不管是哪一个编号的不动产证，都应该能够证明该不动产的所有权、使用权等权利关系。但是，在实际操作中，如果不动产有两个编号的情况，就需要区分哪一个编号的不动产证是真实有效的，哪一个是已经失效的。这就需要对不动产的权利关系进行仔细研究和核实，以确定哪一个编号的不动产证更加可靠和权威。

总之，不动产证有两个编号的情况可能会对不动产的权利关系产生一定的影响，需要仔细核实和研究。对于不动产的所有权、使用权等权利关系，我们需要依据实际情况进行认真判断和处理，以确保权利的合法性和可靠性。