土木工程专业的学硕和专硕在目标、课程设置、毕业要求等方面存在一定的区别。

首先是目标的区别。学硕强调学术研究，培养学术型人才，注重学术理论和方法的研究，侧重培养具有创新能力和综合素质的研究型人才。而专硕则注重实践能力和技术应用，培养专业技术型人才，侧重于培养学生掌握实际应用技能和解决实际问题的能力。

其次是课程设置的区别。学硕的课程设置注重学术研究方法和理论，包括课程、研究生论文和学术活动等。而专硕则注重实践应用技能的培养，课程设置更加注重实际问题的解决和技术应用方面的培养。

最后是毕业要求的区别。学硕毕业要求完成一定的课程学习，通过学术论文答辩等环节来考核学生的学术研究能力和水平。而专硕毕业要求完成一定的实践项目或实践类课程，并进行实践报告和答辩，以考核学生的实践能力和技术应用水平。

总之，学硕和专硕的不同之处在于其培养目标、课程设置和毕业要求等方面存在一定区别。学生在选择时应了解自己的兴趣和发展方向，选择适合自己的专业类型，以便更好地发展自己的职业生涯。