张起灵和吴邪是《盗墓笔记》小说中的两位主人公，他们在一起经历了很多困难和挑战，建立了深厚的友谊。但是，在故事的后期，他们的关系也出现了一些变化。

最开始，张起灵和吴邪是很好的朋友。他们一起探险，一起解决各种难题，一起面对危险。他们之间的默契和信任，让他们成为了不可分割的好伙伴。但是，在《盗墓笔记》的后期，随着情节的发展，张起灵和吴邪之间也出现了一些矛盾。

首先，张起灵开始怀疑吴邪的动机。他认为吴邪过于执着于盗墓事业，而忽略了自己的生命和健康。同时，吴邪的身份和背景也让张起灵感到困惑和疑虑。这些因素让张起灵开始对吴邪的行为和计划产生了怀疑和不信任。

其次，吴邪的行为也让张起灵感到失望。在某些情况下，吴邪为了达到自己的目的，会采取冒险和危险的行为，不顾及自己和身边人的生命安全。这种行为让张起灵感到无奈和担忧，也让他开始质疑吴邪的领导能力和决策能力。

尽管出现了这些矛盾和分歧，但是张起灵和吴邪的友谊并没有因此瓦解。他们依然相互支持和关心，一起面对着各种挑战和危险。在最后的关键时刻，他们再次联手，一起完成了盗墓事业的伟大使命。

因此，张起灵和吴邪的关系可以说是经历了波折，但最终依然保持了深厚的友谊。他们互相理解和包容，一起成长和奋斗，这也成为了《盗墓笔记》故事中最为感人和难忘的部分。